LeafYX · Cariotipo automatico

Un classificatore che impara dai cariotipi del tuo laboratorio.

Il cariotipo automatico usa un classificatore scelto nelle opzioni. Per ogni bandeggio il laboratorio può usare un proprio modello, costruito sui cariotipi che ha verificato, sulla postazione.

Animazione illustrativa: non è una schermata del programma.

01 Dalla lista al modello

Quattro passaggi, tutti sulla postazione.

Il laboratorio verifica i cariotipi, li raccoglie in una lista e genera il modello con cui lavorerà il cariotipo automatico.

  1. 01Cariotipo verificato

    Dall'Elaborazione si aggiunge con un clic alla lista giusta.

  2. 02Lista

    Trovata dal nome del caso e dal bandeggio.

  3. 03Dataset

    Creato dai cariotipi della lista.

  4. 04Modello

    Generato, con l'accuratezza misurata.

Controllo dell'operatore Il cariotipo automatico è una proposta, non una decisione.

Il risultato è sempre correggibile: ogni cromosoma si sposta, si scambia, si ruota e si ribalta a mano, e si può riclassificare. L'addestramento migliora la proposta; la verifica resta all'operatore.

02 Liste di addestramento

Un clic dall'Elaborazione, nella lista giusta.

Quando un cariotipo è stato controllato, lo si aggiunge con un clic alla lista di addestramento. Il programma trova la lista dal nome del caso e dal bandeggio.

  • Una lista e un modello per ciascun bandeggio.
  • Lista trovata dal nome del caso e dal bandeggio.
  • Creazione e apertura delle liste registrate nel diario di audit.
  • Bandeggio Q
  • Bandeggio G
  • Bandeggio R
FIG. 01Cariotipo verificato di un caso di esempio e, sotto, il pannello per aggiungerlo alla lista di addestramento.

03 Confronto e addestramento

Una finestra per sfogliare, creare il dataset, generare il modello.

La finestra di confronto e addestramento riunisce le liste e la galleria. Si controlla il materiale, si crea il dataset e si genera il modello.

  • Bandeggi3 · Q, G e R, un modello ciascuno
  • Classi24 · cariotipo umano, X e Y comprese
  • Lista1 clic per aggiungere un cariotipo verificato
  • GenerazionePochi minuti anche con centinaia di cariotipi *

* Indicazione dalle prove interne, non una prestazione garantita: il tempo dipende dal computer e dalla dimensione della lista.

  • Sfoglia i cariotipi delle liste e la galleria, per controllare che cosa entra nell'addestramento.
  • Crea il dataset dai cariotipi della lista.
  • Genera il modello e mostra l'accuratezza misurata.
  • Durante la generazione, una barra d'avanzamento con tempo trascorso e tempo previsto.
  • La previsione del tempo si affina da sola a ogni generazione.
Scheda Classificatore
Scelta
Nelle opzioni del programma
Bandeggi
Q, G e R, un modello ciascuno
Classi
24 per il cariotipo umano, X e Y comprese
Esito
Accuratezza misurata sul modello generato
Confronto e addestramentoQ · G · R
ListaCariotipi verificati dal laboratorio
DatasetCreato sulla postazione
BandeggioUn modello per Q, G o R
Generazione del modelloTempo trascorso · tempo previsto

Modello generato, accuratezza misurata.

Animazione illustrativa: non è una schermata del programma.

FIG. 02Pannello Addestramento rete neurale: apertura e creazione della lista, scelta del bandeggio (Q, G, R), Crea Dataset e Genera modello.

04 Scelta automatica del modello

Il modello giusto per ogni caso, senza cambiare impostazioni.

Il programma sceglie il modello in base all'identificativo del caso. Gli identificativi accettano caratteri jolly.

  • Più laboratori o più protocolli sulla stessa postazione.
  • Ogni laboratorio o protocollo usa i propri modelli.
  • Il modello segue il bandeggio del caso: Q, G o R.
Scelta del modello
Laboratorio A
Modelli Q, G e R del laboratorio A
Laboratorio B
Modelli Q, G e R del laboratorio B
Altro protocollo
Modelli di quel protocollo

Animazione illustrativa: non è una schermata del programma.

Gli identificativi si definiscono con i caratteri jolly. Il modello scelto dipende anche dal bandeggio.

FIG. 03Cariotipo proposto dal classificatore: resta modificabile dall'operatore.

05 Dati sulla postazione e tracciabilità

Le immagini restano dove sono. Ogni passaggio è scritto.

Dataset e modello si costruiscono localmente: le immagini restano sulla postazione.

  • Creazione delle liste e del dataset sono scritte nel diario di audit.
  • La generazione del modello è registrata, riuscita o fallita; se riuscita, con numero di cromosomi e accuratezza.
  • Ogni riga riporta data, ora, utente, caso e azione.
  • Il diario si scrive sempre sulla postazione.
DataOraUtenteAzione
Lista di addestramento creata
Lista di addestramento aperta
Dataset creato
Modello generato · cromosomi · accuratezza
Generazione del modello non riuscita
Animazione illustrativa: non è una schermata del programma.1 file per giorno e postazione

06 Domande frequenti

Domande sul classificatore.

01Dove restano le immagini usate per l'addestramento?

Sulla postazione. Il dataset e il modello si costruiscono localmente: le immagini restano sul computer del laboratorio.

02Il cariotipo automatico si può correggere?

Sì. Il cariotipo automatico è una proposta: ogni cromosoma si sposta, si scambia, si ruota e si ribalta a mano, e si può riclassificare. Il risultato è sempre controllato dall'operatore.

03Quanto tempo serve per generare un modello?

Nelle prove interne bastano pochi minuti anche con centinaia di cariotipi. È un'indicazione, non una prestazione garantita: il tempo dipende dal computer e dalla dimensione della lista. Durante la generazione una barra mostra il tempo trascorso e il tempo previsto, che si affina a ogni generazione.

04Quale accuratezza si ottiene?

Il programma mostra l'accuratezza misurata per ogni modello generato. Dipende dai preparati del singolo laboratorio e, nelle prove interne, cresce con il numero di cariotipi della lista: per questo non indichiamo percentuali.

05Si possono usare modelli diversi per protocolli o laboratori diversi?

Sì. Il modello si sceglie in automatico in base all'identificativo del caso, anche con caratteri jolly. Più laboratori o protocolli possono lavorare sulla stessa postazione, ciascuno con i propri modelli.

06Serve un modulo particolare?

Il classificatore fa parte del cariotipo automatico di LeafYX. I moduli della licenza, su chiave hardware, si definiscono insieme al laboratorio: scrivici dalla pagina Contatti.

07 Continua

Approfondisci.

Solo per uso di ricerca.

LeafYX è un software per la ricerca in citogenetica. Solo per uso di ricerca (RUO): non è un dispositivo medico e non è destinato a uso diagnostico.

Il cariotipo automatico produce una proposta: classificazione e disposizione dei cromosomi restano sotto la verifica dell'operatore.

Demo

Valuta il classificatore sui tuoi preparati.

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